Au cours de ses 56 années d'activité, l'IDEP a développé une solide tradition de partenariat avec les parties prenantes du développement économique de l'Afrique, notamment les États membres, les institutions panafricaines, les universités et les instituts de recherche, les organismes régionaux et sous-régionaux, les organisations non gouvernementales et les partenaires du développement. Récemment, ces partenariats se sont étendus au secteur privé et philanthropique. Ces partenariats sont des relations volontaires et collaboratives dans lesquelles l'IDEP et ses partenaires respectifs acceptent de travailler ensemble pour atteindre un objectif commun d'une manière où les responsabilités, les compétences, les recours, les risques et les bénéfices sont partagés.